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L’appellation  Champignon  s’applique en français à plusieurs taxons distincts. Les champignons sont des assiettes pour l’Empereur PDF eucaryotes pluricellulaires ou unicellulaires. Le terme  champignon  est devenu ambigu car il désigne un taxon obsolète.


Cependant, la découverte en 1991 d’Ötzi révèle que cet homme, vivant vers 2500 av. Le mousseron, perçu comme poussant dans la mousse, a donné en anglais le nom générique du champignon, mushroom. Dans la langue commune, le terme  champignon  désigne un organisme vivant charnu, constitué généralement d’un pied surmonté d’un chapeau, à l’image du champignon de Paris ou du bolet. Aussi loin que remontent les sources documentaires, les champignons ont attiré les hommes pour leurs propriétés comestibles ou hallucinogènes. Ils les ont aussi effrayés par leur toxicité. La croyance en une génération spontanée a longtemps persisté même parmi les savants.

Schilling eut beau, lui aussi, publier des dessins soignés de ses observations, rien n’y fit : ceux qui considéraient les champignons comme le produit de la génération spontanée restaient toujours nombreux. Linné a souvent été plus ou moins controversée. La comparaison des séquences de gènes permet de reconstruire l’histoire évolutive des êtres vivants en suivant les modifications de leur génome. La classification des champignons relève de la mycologie. Deux classifications sont actuellement proposées: la classification classique et la classification phylogénétique. L’usage du mot champignon s’est alors étendu dans le langage commun à des formes biologiques très diverses.

Il y a de très nombreuses espèces de champignons, dont épiphytes, endogés ou aquatiques, et il en reste beaucoup à découvrir. Il existe cependant bien d’autres espèces appelées champignons, qu’elles soient uni- ou pluri-cellulaire, tels que les rouilles, les levures, les moisissures ou encore certains parasites de l’homme . Bien qu’ayant été par le passé regroupées au sein d’un même groupe, elles peuvent n’avoir que peu de rapport entre elles. Certains champignons microscopiques sont responsables de pathologies humaines infectieuses. Certains champignons peuvent également se révéler pathogènes d’un point de vue toxique en cas d’ingestion. Ces champignons sont des parasites véritables des arbres, puisqu’ils s’attaquent à de la matière végétale vivante causant leur dépérissement jusqu’à leur mort après quelques années dans certains cas, selon la virulence du champignon en question. Le parasitisme par les champignons se produit quelquefois en réponse à un stress important que l’arbre a subi.

Ainsi, l’arbre ayant perdu sa couche de protection externe est exposée à plusieurs parasites dont les spores des champignons. De plus, dans ces cas, l’impact écologique sur l’abondance d’une espèce d’arbre dans nos forêts est souvent minime, puisque le phénomène se produit à petite échelle, à l’exception de tous les phénomènes naturels causant des stress beaucoup plus importants. Par contre, certains champignons n’ont pas besoin de profiter de ces altérations majeures. Ainsi, un champignon pourrait avoir comme hôte primaire, par exemple, un insecte, qui lui permettra de passer à travers la barrière végétale d’un arbre et d’y implanter ledit parasite mycologique. L’utilisation des champignons remonte probablement aux temps les plus reculés. Toutes les mythologies ont en commun de considérer les champignons comme étant les produits d’une réaction mystérieuse entre la terre humide et un élément surnaturel.